福建省环三都澳区域绿色发展基金会现有理事25名，监事5名。基金会设理事会，理事会设理事长1名，副理事长2名，其中1名副理事长兼秘书长1名。

　　基金会属于地方性公募基金会。由福建省民政厅登记管理，宁德市人民政府作为业务主管单位，为进一步加强日常监督管理，宁德市人民政府授权宁德市环境保护局作为基金会日常监督管理单位。

　　基金会的宗旨：广泛动员社会民众关心和支持环三都澳区域的环境保护事业，吸引社会各界共同参与环三都澳区域的生态环境保护工作，关注环三都澳区域内的企业淘汰落后产能、生态环境修复治理，生物多样性保护、促进产业转型升级和社会环境可持续发展。